サーバ内のファイルが一覧表示されている段階で右クリック→[FTP Commands]−[SITE]を開いて小窓を開く。

小窓に以下のように書き込む。 パーミッションを７５５にしたいとき　chmod 755 ***.cgi ***.cgiは該当するCGIのファイル名になります。 パーミッションを６６６にしたいとき　chmod 666 ***.log ***.logは該当するファイル名になります。